Rad Agencije uređen je zakonima Crne Gore, prije svega Zakonom o energetici iz 2003. godine kojim je i osnovana.

U svom radu Agencija poštuje i izvršava obaveze iz međunarodnih akata čiji je Crna Gora potpisnik ili koji je obavezuju.To je prije svega Sporazum o formiranju Energetske zajednice zemalja Jugoistočne Evrope  koji je Skupština Crne Gore ratifikovala u oktobru mjesecu 2006. godine.

Agencija u skladu sa ovlašćenjima utvrđenim Zakonom o energetici donosi opšte akte u svrhu regulisanja energetskog sektora Crne Gore.

Agencija donosi interne akte kojima uređuje unutrašnju organizaciju, način rada i poslovanja itd.